厌氧反应器进水经过布水器输入反应器，与下降管循环来的污泥和出水均匀混和后，进入反应分离区内，流化床反应室。在那里，大部分COD被降解为沼，在这个分离区产生的沼由低位三相分离器收集和分离，并产生体提升。体被提升的同时，带动水和污泥作向上运动，经过一级“上升”管达到位于反应器部的体/液体分离器，在这里沼从水和污泥中分离，离开整个反应器。水和污泥混和经过同心的“下降”管直接滑落到反应器底部形成内部循环流。从*级分离区的出水在二阶段低负荷后处理区内被深度处理，在那里剩余的可生物降解的COD被去除，在上层分离区产生的沼被部的三相分离器收集，并沿二级“上升管”，输送到部旋流式体/液体分离器，实现沼分离和收集。同时，厌氧出水经过出水堰离开反应器自流进入后续处理中。
IC厌氧反应器的构造及其工作原理决定了其在控制厌氧处理影响因素方面比其它反应器更具优点。
(1)容积负荷高：IC反应器内污泥浓，微生物量大，且存在内循环，传质，进水机负荷可超过普通厌氧反应器的3倍以上。
(2)节省投资和占地面积：IC反应器容积负荷率高出普通UASB反应器3倍左右，其体积相当于普通反应器的1/4~1/3左右，大幅度的降低了反应器的基建投资[5]。而且IC反应器高径比很大(一般为4~8)，所以占地面积别省，很适合用地紧张的工矿企业。
(3)抗冲击负荷能力强：处理低浓度废水(COD=2000~3000mg/L)时，反应器内循环流量可达进水量的2~3倍；处理高浓度废水(COD=10000~15000mg/L)时，内循环流量可达进水量的10~20倍[5]。大量的循环水和进水充分混合，使原水中的害物质得到充分稀释，大幅度的降低了毒物对厌氧消化过程的影响。
(4)抗低温能力强：温度对厌氧消化的影响主要是对消化速率的影响。IC反应器由于含大量的微生物，温度对厌氧消化的影响变得不再突出和严重庆。通常IC反应器厌氧消化可在常温条件(20~25℃)下进行，这样减少了消化保温的困难，节省了能量。
(5)具缓冲pH的能力：内循环流量相当于1厌氧区的出水回流，可利用COD转化的碱度，对pH起缓冲，使反应器内pH保持状态，同时还可减少进水的投碱量。
(6)内部自动循环，不必外加动力：普通厌氧反应器的回流是通过外部加压实现的，而IC反应器以自身产生的沼作为提升的动力来实现混合液内循环，不必设泵强制循环，节省了动力消耗。
(7)性好：利用二级UASB串联分级厌氧处理，可以补偿厌氧过程中K s高产生的不利影响。Van Lier[6]在1994年证明，反应器分级会降低出水VFA浓度，延长生物停留时间，使反应进行稳定。
(8)启动周期短：IC反应器内污泥活性高，生物增殖快，为反应器快速启动提供利条件。IC反应器启动周期一般为1～2个月，而普通UASB启动周期长达4～6个月。
(9)沼使用价值高：反应器产生的生物纯，CH4为70%～80%，CO2为20%～30%，其它机物为1%～5%，可作为燃料加以利用。
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